Ялтинская пещера как и Трехглазка и Геофизическая имеет карстовое происхождение и была известна еще древним людям эпохи неолита, здесь были обнаружены следы их стоянки. Ялтинская пещера была открыта в 1997 году, а оборудована для посещения туристами в 2007. Пещера расположена на глубине 31 метр и имеет протяженность 180 метров, хотя для осмотра доступен лишь большой главный зал.